Причин может быть несколько: глисты, простейшие, инфекции (вирусный энтерит собак, лептоспироз, вирусный гепатит), инородное тело, непроходимость кишечника...
Важно знать вакцинирован ли щенок. Необходимо сдать анализ кала - общий, на простейших, анализ на энтерит, может потребоваться...